WCS sistēma ir atbildīga par plānošanu starp sistēmu un aprīkojumu un nosūta WMS sistēmas izdotās komandas katrai iekārtai saskaņotai darbībai. Pastāv nepārtraukta saziņa starp iekārtu un WCS sistēmu. Kad iekārta pabeidz uzdevumu, WCS sistēma automātiski veic datu ievietošanu ar WMS sistēmu.